Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms