Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms