Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVFC1P60507 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms