Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PROK1P58294 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PROK1P58294 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PROK1P58294 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PROK1P58294 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms