Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms