Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms