Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD23BP54727 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms