Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK1P53667 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms