Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2A2P52657 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2A2P52657 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms