Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms