Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP3P50461 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms