Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANGAP1P46060 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms