Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP2P42575 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP2P42575 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms