Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms