Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTRLP40313 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTRLP40313 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms