Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms