Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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