Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCAP28676 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCAP28676 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCAP28676 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms