Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms