Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRGP23470 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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