Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
GCSHP23434 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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