Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms