Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP2AP11388 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP2AP11388 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms