Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBSLP0DN79 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms