Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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PKHD1P08F94 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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