Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL4O60488 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms