Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNC1O60486 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms