Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms