Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCC3O15438 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC3O15438 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms