Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms