Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356.8 ms