Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
USP9YO00507 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms