Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PCH4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PCH4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PCH4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PCH4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms