Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms