Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POMPQ9Y244 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms