Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVW-1Q9UQF0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms