Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSEQ9UL01 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms