Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRPC4Q9UBN4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRPC4Q9UBN4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms