Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRBP1Q9P2E9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms