Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD5Q9P267 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms