Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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