Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSD3Q9NYI0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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