Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COMMD8Q9NX08 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COMMD8Q9NX08 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms