Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms