Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX15Q9NRS6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms