Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMPRSS4Q9NRS4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms