Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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RAB9BQ9NP90 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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