Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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