Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms