Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCT6P3-203ENST00000452026 1383 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRKB-201ENST00000272424 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP19-201ENST00000342619 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP3-3-201ENST00000391586 704 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007879.1-201ENST00000435643 554 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms